Pues en mi caso .. usamos TGA y el exportador que podrás encontrar en mi web (
http://www.nerlaska.com/msx)
En el TGA hacemos lo siguiente.
Definimos Sprites de 8x8 o de 16x16 .. y usamos el color RGB (255,0,255) para establecer el fondo. Es un rosa chillón.
Los Sprites los ponemos en horizontal o vertical o da igual, porque al exportar automaticamente tiene en cuenta el ancho y el alto de la imagen y
como tu especificas si son de 16x16 o de 8x8 el exportador ya se busca la vida.
Para el color del sprite solemos usar cualquier otro color ... el grafista suele poner el que mas le gusta de MSX pero vamos .. mientras no sea el rosa chillón cualquiera vale.
Podrás exportar en plan RAW comprimido o sin comprimir y también podrás generar un archivo de texto (.H) que te puede venir bien para declarar los DATA en MSXBASIC.
Espero que te sirva. Sea como sea .. si este método no te convence .. por ahi hay herramientas muy majas para hacer sprites.